引起呼吸困难的原因是多方面的。
从呼吸系统本身来讲，气道阻塞是常见因素，像异物进入气管、支气管哮喘发作导致气道狭窄，还有慢性阻塞性肺疾病也会使气流受限。肺部疾病也会引发，例如肺炎、肺纤维化，肺炎会使肺部的气体交换功能受损，肺纤维化会让肺的弹性降低、气体交换面积减少。
心血管系统问题也可能引起呼吸困难。比如左心衰竭时，肺部会淤血，影响氧气和二氧化碳的交换；还有心脏瓣膜病，也会导致心脏功能异常，引起肺部血液循环障碍，进而出现呼吸困难。
另外，中毒也会导致呼吸困难。例如一氧化碳中毒，它会和血红蛋白结合，使血红蛋白失去携氧能力；还有某些药物中毒，抑制了呼吸中枢，影响呼吸功能。
神经精神性因素也不可忽视。像脑外伤、脑出血等颅脑疾病会影响呼吸中枢的调节
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